По настоянию врачей четыре-пять теплых месяцев семья ежегодно проводила в Крыму. Сначала жили в Ялте, затем открыли для себя соседний Гурзуф с его старинным парком, в котором бывал Пушкин, фешенебельными гостиницами, прекрасным рестораном и больницей. Весной 1910 года там отдыхали девяностодвухлетний Петипа с женой и младшей дочерью. На последней фотографии он вполне бодр и по-прежнему элегантен. Но в июне Мариус Иванович неожиданно слег — хронический бронхит перешел в жесточайшее воспаление легких. Предчувствуя близкую кончину отца, в Крым устремились многочисленные дети...
Великого хореографа не стало утром первого июля. Тело везли через всю Россию: траурный поезд прибыл на Николаевский вокзал Санкт-Петербурга только восьмого числа.
Еще в 1903 году Петипа распорядился по поводу своих похорон: «Все обязательно должно быть очень скромно. Две лошади для дрог. Никаких приглашений. Только объявление в газетах». Некрологов вышло множество. В одном, опубликованном в «Обозрении театров», говорилось: «Петипа не умер, он был и останется навсегда альфой и омегой русской балетной сцены. Сказать, что Мариус Иванович создал русский балет и русскую образцовую балетную школу, — далеко не будет преувеличением».
Патриарха танца похоронили на Волковом лютеранском кладбище, но в 1948 году прах перенесли в некрополь мастеров искусств Александро-Невской лавры.
«Вспоминая свою карьеру в России, могу сказать, что то была наисчастливейшая пора моей жизни, — признавался Петипа в мемуарах. — Да хранит Бог мою вторую родину, которую я люблю всем сердцем».